Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms