Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrimpolQ6P1E7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrimpolQ6P1E7 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms