Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarca2Q6DIC0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms