Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp4Q68FH0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms