Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg9aQ68FE2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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