Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ss18Q62280 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Ss18Q62280 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ss18Q62280 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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