Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5dQ62240 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5dQ62240 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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