Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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