Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BcanQ61361 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BcanQ61361 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms