Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
AcanQ61282 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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