Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbbp4Q60972 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms