Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a4Q60857 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a4Q60857 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Slc6a4Q60857 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Slc6a4Q60857 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Slc6a4Q60857 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Slc6a4Q60857 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Slc6a4Q60857 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc6a4Q60857 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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