Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mkrn3Q60764 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 575.3 ms