Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SkilQ60665 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SkilQ60665 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms