Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms