Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rbm27Q5SFM8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rbm27Q5SFM8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rbm27Q5SFM8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rbm27Q5SFM8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rbm27Q5SFM8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rbm27Q5SFM8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rbm27Q5SFM8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm27Q5SFM8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm27Q5SFM8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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