Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Herc2Q4U2R1 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms