Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc185Q3V118 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms