Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms