Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sec31aQ3UPL0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sec31aQ3UPL0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sec31aQ3UPL0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Sec31aQ3UPL0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sec31aQ3UPL0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sec31aQ3UPL0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sec31aQ3UPL0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sec31aQ3UPL0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec31aQ3UPL0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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