Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp30Q3UN04 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp30Q3UN04 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp30Q3UN04 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp30Q3UN04 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms