Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hectd3Q3U487 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hectd3Q3U487 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hectd3Q3U487 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hectd3Q3U487 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms