Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms