Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Srsf6Q3TWW8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms