Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1aQ2LKU9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms