Protein–RNA interactions for Protein: Q14DH7

Acss3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss3Q14DH7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Acss3Q14DH7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms