Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ptcd3Q14C51 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ptcd3Q14C51 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ptcd3Q14C51 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ptcd3Q14C51 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ptcd3Q14C51 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ptcd3Q14C51 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ptcd3Q14C51 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ptcd3Q14C51 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ptcd3Q14C51 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms