Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd2Q149F1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms