Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Spatc1Q148B6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms