Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ttc39dQ0VF76 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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