Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc1Q0VDN7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms