Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms