Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vps8Q0P5W1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vps8Q0P5W1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms