Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cib3Q0P523 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms