Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Znf541Q0GGX2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms