Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tgm3Q08189 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms