Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox12Q04890 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms