Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp39Q02525 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms