Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ascl1Q02067 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms