Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Grin2cQ01098 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Grin2cQ01098 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms