Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde1bQ01065 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pde1bQ01065 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde1bQ01065 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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