Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax8Q00288 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax8Q00288 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.3 ms