Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stx2Q00262 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms