Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smarcc1P97496 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms