Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Bop1P97452 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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