Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-3P97334 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms