Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Arf1P84078 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Arf1P84078 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms