Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gabpb2P81069 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms