Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irx3P81067 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms