Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NfixP70257 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfixP70257 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfixP70257 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfixP70257 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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